Жемалетдинов родился в спортивной семье. Отец Рифата – профессиональный пловец. По его стопам мог пойти Жемалетдинов-младший, но выбрал в итоге футбол. В «Локомотиве» Рифат с пяти лет – он прошел Академию клуба с набора до выпуска.

В «молодежку» Жемалетдинов попал в 2013 году и быстро стал одним из лидеров. Дебют в главной команде состоялся 25 февраля 2016-го в матче 1/16 финала Лиги Европы с «Фенербахче». Первый гол за «Локомотив» Рифат забил в мае того же года с «Мордовией». Тогда же состоялся и первый дубль.

В 2013-м Жемалетдинов выиграл юношеский чемпионат Европы, в 2015-м завоевал серебро юношеского Евро, а в 2016-м стал победителем молодежного первенства России.